はい。

オフィスあんしんレンタルサーバーに設定している全てのメールアドレスがチェック対象となります。
設定しているメールアドレスでメールを送受信した際にウィルスチェックの対象となります。
なお、設定されているメールアドレスをウィルスチェックの対象から外すことはできません。