いいえ、メールごとに暗号化する/暗号化しないを設定することはできません。
ただし、外部宛て、内部宛てにより暗号化する/しないをあらかじめ設定することは可能です。
また、添付ファイルを暗号化せずにメール送信する「差出人」と「宛先」をホワイトリストに設定することができます。

添付ファイル自動暗号化の詳細につきましては、
FAQ ID: 60517 「【プレミアム】 添付ファイル自動暗号化の詳細について教えてください。」をご確認ください。